Adquirida pelo Grupo em 1956 e localizada em Sertãozinho/SP, atualmente a Usina São Francisco tem capacidade de moagem de 1,5 milhões de toneladas de cana de açúcar por safra e possui a planta industrial flexível para a produção de açúcar VVHP, açúcar orgânico, etanol hidratado, etanol neutro orgânico e etanol neutro. Sua planta é 100% automatizada em todas as suas etapas e produziu na Safra 16/17 102.387,000 toneladas de açúcar e 50.780.000,000 litros de etanol, e geração de 4.179,73 MW/h de energia.